با توجه به ظرفیت های موجود در حوزه شیلات و آبزی پروری در جزیره قشم و ت سازمان منطقه آزاد قشم در توسعه فعالیت های شیلاتی، آبزی پروری (تکثیر و پرورش میگو، پرورش ماهی در قفس) و همچنین صنایع تکمیلی و وابسته با هدف ایجاد ارزش افزوده و در راستای ت های کلان کشور در قالب تامین امنیت غذایی و اقتصاد مقاومتی اداره شیلات و کشاورزی سازمان به عنوان واحدی مستقل از سال 1395 آغاز به کار نمود.

همچنین با عنایت به ظرفیت موجود در حوزه کشاورزی و دام پروری جزیره قشم و ت های اتخاذ شده جهت توسعه فعالیت های کشاورزی و دام پروری از جمله احیا باغات سنتی جزیره، تبدیل کشاورزی سنتی به مکانیزه، تبدیل دامپروری سنتی به صنعتی، احداث طرح های گلخانه ای و آبرسانی به اراضی کشاورزی خصوصا نخیلات، توانمندسازی جوامع محلی جزیره و صنایع تکمیلی وابسته در این زمینه در راستای ت های کلان کشوردر قالب تامین امنیت غذایی و اقتصادی و همچنین با هدف و نگرش جزیره ای سرسبز و عاری از هرگونه آلودگی، اداره شیلات و کشاورزی سازمان از سال 1395 آغاز به کار نمود تا بتواند پاره ای از مشکلات مردمان این جزیره که قبلا با شغل کشاورزی امرار معاش می نموده اند را حل نماید.